Na actualidade, o Convento de San Francisco de Santiago de Compostela mantén viva a misión franciscana de servizo, evanxelización e axuda aos máis necesitados. A través do Centro Cultural-Social Juan XXIII, os franciscanos desenvolven numerosos proxectos educativos e de acción social dirixidos a persoas e colectivos que sofren situacións de pobreza ou exclusión. O seu labor baséase na defensa da dignidade humana, a solidariedade e o acompañamento dos que atravesan dificultades económicas ou sociais. Ademais, organizan cursos de formación laboral, actividades educativas e programas de integración para favorecer a inclusión e a mellora das condicións de vida de moitas persoas.

Xunto a este labor social, o convento continúa sendo un importante centro de vida relixiosa. A Igrexa Conventual de San Francisco acolle celebracións litúrxicas, actividades de catequesis para nenos e mozos, o grupo scout Tau, encontros formativos e espazos de oración para a comunidade cristiá. Deste xeito, os franciscanos seguen transmitindo a mensaxe de San Francisco de Asís, promovendo valores como a fraternidade, a sinxeleza, a paz e o amor a Deus e ao próximo.

Outro aspecto destacado do seu traballo é a atención ás persoas máis vulnerables mediante o Albergue Juan XXIII, obra social dos franciscanos. Este servizo ofrece acollida, aloxamento temporal, hixiene, alimentación, roupeiro e apoio humano a persoas sen recursos, ademais de facilitar actividades formativas que favorecen a súa integración social. Grazas a estas iniciativas, o convento continúa sendo, máis de oitocentos anos despois da súa fundación, un referente de axuda, hospitalidade e compromiso cos máis necesitados na cidade de Santiago de Compostela.