Un día, Francisco atopouse cun leproso no camiño. Aínda que sentía un gran temor cara a esta enfermidade, decidiu acercarse ao home, abrazalo e axudalo. Máis tarde diría que aquilo que antes lle resultaba amargo converteuse en dulzura para a súa alma.
Pouco despois, mentres rezaba ante o crucifixo da igrexa de San Damián, escoitou unha voz que lle decía: "Francisco, repara mi Iglesia". Desde entón comezou un camiño de conversión que transformaría completamente a súa vida e a vida da igrexa.